Το Περιφερειακό Ταμείο Ανάπτυξης Κεντρικής Μακεδονίας από το 2009 ανέπτυξε και εφαρμόζει Σύστημα Διαχείρισης Ποιότητας, σύμφωνα με το Διεθνές Πρότυπο ELOT ΕΝ ISO 9001, για την «Οικονομική Διαχείριση και Διεκπεραίωση Πληρωμών Έργων του Προγράμματος Δημοσίων Επενδύσεων. Υλοποίηση Έργων που ανατίθενται στο ΠΤΑΚΜ από τα Υπουργεία, την Περιφέρεια, τους ΟΤΑ, τα ΝΠΔΔ, καθώς και Έργων Προγραμμάτων της Ευρωπαϊκής Ένωσης».
Το Σύστημα Διαχείρισης Ποιότητας του ΠΤΑ ΚΜ, πιστοποιήθηκε σύμφωνα με το πρότυπο ELOT ΕΝ ISO 9001:2015, από τον ανεξάρτητο Φορέα Επιθεωρήσεων και Πιστοποιήσεων EUROCERT.